Aciculaire : Ce dit des organes en forme d’aiguille Aerobie/aérobe : se dit d'un organisme tolérant la présence d'oxygène pour vivre. L'aérobiose est dite stricte ou obligatoire si l'organisme nécessite la présence d'oxygène pour croître. Aérocyste (ou flotteur) : Partie du thalle, en forme de vésicule, assurant une certaine flottabilité en raison du gaz qu’elle contient. Agar-Agar : Substance gélatineuse extraite de certaines algues marines et utilisée pour solidifier les milieux de culture et aussi dans l'alimentation. Agarophyte : Algue rouge (par exemple Gelidium ou Gracilaria) dont les parois cellulaires contiennent de I’agar. Alginates ou acide alginique: Substances insolubles gélatineuses que l'on trouve à l'état de sels dans certaines algues. Alginophyte : Algue brune (par exemple Laminaria, Cystoseira) dont les parois cellulaires contiennent de l’acide alginique. Algues : Végétaux aquatiques, pourvus de chlorophylle, mais dépourvus de véritables tiges, racines, feuilles et vaisseaux. Amibe : une amibe est un type de cellule eucaryote qui se déplace en utilisant des pseudopodes qui sont des extensions cytoplasmiques dynamiques fabriquées à l'aide du cytosquelette d'actine. Elles peuvent être uni- ou pluri-nucléées. Amidon : Polysaccharide de réserve (à base de glucose), chez les Chlorophytes; localisé à l’intérieur des plastes (intraplastidial). Amidon cyanophycéen (ou Cyanamylon) : Polysaccharide (à base de glucose), chez les Cyanophytes; souvent rapproché du glycogène. Amidon floridéen (ou Rhodamylon) : Polysaccharide de réserve (à base de glucose), chez les Rhodophytes; localisé dans le cytoplasme (donc extraplastidial). Amont/Aval : L’amont et l’aval d’un cours d’eau ne peuvent être traités séparément. Peu importe où vous vous trouvez sur le bord d’un cours d’eau, l’amont est le côté d’où vient le courant alors que l’aval est le côté vers lequel descend le courant. Anabolisme : ensemble des réactions du métabolisme qui participent à l'élaboration de la matière organique complexe à partir d'éléments plus simples. Exemples: photosynthèse, biosynthèse des protéines... Anaérobie/anaérobe: se dit d'un organisme tolérant l'absence d'oxygène pour vivre. L'anaérobiose est dite stricte ou obligatoire si l'organisme meurt en présence d'oxygène. Anisogamie : Union de Deux gamètes morphologiquement dissemblables. Archéoplastidié : Type de structure plastidiale caractérisant les algues qui
possèdent un seul plaste par cellule. Aseptiques: Conditions aseptiques : conditions stériles, sans organismes indésirables. Autogamie : Chez les Champignons, fusion par paire de noyaux à polarités
différentes à l’intérieur d’un même article ou plasmode. Berges : Partie
latérale plus ou moins escarpée du lit d’un lac ou d’un cours d’eau qui peut
être submergée sans que les eaux ne débordent. Carpophore : ou sporophore Partie apparente des champignons et siège des organes de reproduction (basides ou asques) Carpospore : Spore non flagellée, formée dans un carposporocyste (chez les Rhodophytes) et considérée généralement comme diploïde. Carposporophyte : Génération (généralement diploïde) correspondant aux gonimoblastes, chez les Rhodophytes; toujours parasite du gamétophyte femelle. Carrageenines : Substance extraite de certaines algues marines et servant
d'émulsifiant en cuisine. Catabolisme : Ensemble des réactions du métabolisme qui participent à la dégradation de la matière organique en éléments plus simples. Exemples: glycolyse, respiration... Cellulose: Un composant organique de bois, de la paille etc., qui se dégrade plus facilement que la lignine. C’est le matériau brut à partir duquel on fabrique du papier. Les déchets de coton contiennent de grandes quantités de cellulose. La sciure de bois contient de la cellulose, de l’hémicellulose et de la lignine. Conceptacle : Cavité dans le thalle de certaines espèces (comme les Fucales) où sont localisés les organes reproducteurs. Champignonnière: Une champignonnière est un lieu de culture de champignons. Elles sont installées en milieux sombres et humides, aux conditions idéales pour le développement des champignons. Le plus souvent on y cultive l'agaricus, plus connu sous le nom de champignon de Paris ou champignon de couche mais on peut aussi cultiver la pleurote, la truffe, la morille, le pied-bleu, le champignon noir et le shiitaké pour les plus courants. Chimio-autotrophie (lithotrophie): autotrophie où la source d'énergie est un potentiel chimique. Exemple de chimio-autotrophes : bactéries du genre Thiothrix utilisant H2S comme source d'énergie et l'oxydant en SO42-. Chlorophylle
a : Pigment vert présent dans les cellules des
plantes et des algues qui joue un rôle essentiel dans la photosynthèse. Puisque
la chlorophylle a est directement liée à la quantité d’algues en suspension
dans l’eau, on mesure sa concentration pour déterminer le niveau trophique d’un
lac. Coliformes fécaux : Bactéries intestinales provenant des excréments produits par les animaux à sang chaud, incluant l’humain et les oiseaux. Leur présence dans l’eau est indicatrice d’une contamination fécale et de la présence potentielle de microorganismes pathogènes susceptibles d’affecter la santé animale et humaine. Conidie : Spore assurant la reproduction asexuée des champignons : conidiospore. Conidiophore : Filament d’un Champignon portant des conidies Cortex : Couche externe dure du pied de certains champignons Crampons : Filaments servant à fixer un organisme Thallophyte au substrat Croissance diffuse : Type de croissance où la plupart des cellules du thalle sont capables de se diviser. Crue : Élévation du niveau d’un cours d’eau, due à des pluies
abondantes ou à la fonte des neiges. Cyanobactéries : Les cyanobactéries, aussi appelées algues bleues ou algues bleu-vert, ressemblent beaucoup aux algues aquatiques, mais s’apparentent aux bactéries. Elles possèdent des pigments qui leur confèrent une coloration généralement bleu-vert. Plusieurs cyanobactéries peuvent utiliser l’azote gazeux et sont donc grandement favorisées par des eaux riches en phosphore. De plus, certaines espèces produisent des toxines et peuvent ainsi rendre l’eau toxique. Cyste : Toute cellule fertile chez les Thallophytes (sporocyste, gamétocyste, zoïdocyste). Cystides : Sorte de poils stériles accompagnant les basides chez beaucoup de champignons. Cystocarpe : Chez les Rhodophytes, organe de reproduction (“fruit”) porté par les gamétophytes femelles; constitué par le gonimoblaste (carposporophyte) et par une enveloppe protectrice de cellules appartenant au gamétophyte. Cystogamie : Reproduction chez les Champignons Zygomycètes et les Algues
Zygophycées : Conjugaison. Diatomées : Algues microscopiques qui peuvent devenir visibles en colonies ou enfermées dans une coque siliceuse. Elles sont les principaux constituants du phytoplancton. Dicaryon : Noyaux conjugués associés par paire. Ils se divisent toujours simultanément par des mitoses. Dichotome : Type de ramification qui, à partir d’un rameau unique, engendre
2 rameaux fils identiques. Dioïque : Espèce où il existe deux types indépendants d’individu fertile, l’un engendrant les gamétes mâles et l’autre les femelles Écosystème : Ensemble comprenant les organismes et le milieu naturel dans lequel ils vivent. Dans un écosystème, il y a des organismes vivants (végétaux, animaux, bactéries, etc.) et des éléments non vivants qui sont en relation et forment un système en équilibre. Embouchure : L’embouchure est la partie où le cours d’eau se termine, là où il se jette dans un autre cours d’eau. On utilise également se terme pour définir l’endroit où un lac se déverse (synonyme : exutoire). Endolithique : Qui vit dans les roches ou tout autre substrat présentant des caractères semblables, comme les coquilles par exemple (les substrats colonisés sont souvent calcaires). Endophytique : Qui vit à l’intérieur des tissus d’un végétal. Endozoïque : Qui vit à l’intérieur des tissus d’un animal. Energide : Unité physiologique d’une structure Coenocytique constituée par un noyau et le cytoplasme qui l’entoure. Envasement : Surélévation du fond d’une étendue d’eau ou du lit d’un cours d’eau à la suite d’un dépôt de sédiments. Epilithique : Qui vit à la surface des rochers. Épiphyte : Algue qui croît sur une autre ou fixée à celle-ci, s'en servant uniquement comme un support. Epizoïque : Qui vit sur un animal. Espèces: Unité fondamentale de classification biologique. En général deux individus appartiennent à la même espèce s’ils peuvent produire des descendants fertiles. Étang : Étendue d’eau reposant dans une cuvette dont la profondeur n’excède généralement pas deux mètres au milieu de l’été. Le couvert végétal, s’il existe, se compose surtout de plantes aquatiques submergées et flottantes. Étiage : L’étiage est le niveau le plus bas atteint par un cours d’eau ou un lac au cours d’une année. (Synonyme : basses eaux). Euphotique : Caractérise les couches de l'océan qui reçoivent suffisamment de lumière pour permettre la photosynthèse. Eutrophe : Se dit d’un plan d’eau riche en nutriments (azote et surtout phosphore) et en matière végétale. Il s’agit d’un stade avancé d’eutrophisation qui conduit entre autres à une modification des communautés animales, à un accroissement de la matière organique et à un déficit d’oxygène dans les eaux profondes. Eutrophisation : L’eutrophisation, aussi appelée vieillissement d’un plan d’eau, est l’enrichissement en matières organiques et en éléments nutritifs qui conduit à la prolifération des végétaux aquatiques. La multiplication et la décomposition de ces végétaux entraînent des modifications de la qualité de l’eau dont l’appauvrissement de l’oxygène des eaux profondes ainsi que des changements biologiques telle la mortalité de certaines espèces de poissons. Extraplastidial : Qui se trouve à l’extérieur du plaste. N.B. un pyrénoïde “extraplastidial” (chez les Chromophytes par exemple), bien que situe à l’extérieur du stroma plastidial, est cependant situé à l’intérieur de la membrane externe du plaste. Exutoire : L’exutoire est une ouverture dans un plan d’eau qui permet
l’écoulement des eaux. L’exutoire est l’endroit où se déversent les eaux du
lac. Comme le niveau de l’eau ne peut monter au-dessus du niveau de l’exutoire,
celui-ci contrôle en même temps le niveau du lac: embouchure, émissaire. Filament : Terme descriptif de morphologie; souvent réservé aux thalles formés de files, bien individualisées, de cellules (peut être unisérié, plurisérié, etc.). Foliacé : Terme descriptif de morphologie; thalle présentant un aspect de feuille (épaisseur faible par rapport à grandes longueur et largeur). Fongique : Qui a trait aux champignons. Fosse : Zone la plus profonde d’un plan d’eau. Frayère : Lieu où les poissons se reproduisent et déposent leurs œufs. Frustule : Paroi siliceuse des cellules des diatomées (Bacillariophytes) formée de 2 valves emboîtées; les décorations de ces valves sont utilisées comme critères taxinomiques. Gabion : Cage en treillis métallique remplie de pierres rangées à la main. L’ensemble de plusieurs gabions se veut un dispositif de protection ou de soutien des rives. Gamète : Cellule reproductrice mâle ou femelle, parvenue à maturité. Gamétocyste : Cellule gamétogène dont le contenu se transforme en gamètes chez les thallophytes. Gamétophyte : Thalle portant des gamétocystes. La génération gamétophytique est souvent haploïde chez les algues. Gamie : Union de deux gamètes Génération: Partie du cycle de vie commençant à l’œuf (ou à une spore) et se terminant à la formation de spores (générations sporophytiques) ou, de façon complémentaire, commençant à une spore et se terminant à des gamètes (génération gamétophytique). Gonimoblaste : Ensemble de cellules qui, chez les Rhodophytes, engendrent les carpospores, directement ou indirectement à partir du carpogone, généralement après fécondation (donc diploïde). Haploïde : Etat d’un individu ou d’une cellule possédant un seul génome Haplostique : Type de structure caractérisé par des cellules non recloisonnées suivant des plans longitudinaux. Haptères : Organes cylindriques et souvent ramifiés, situés à la base de certains thalles et en assurant la fixation comme chez Laminaria. Haptonème: Appendice filiforme constitué de microtubules dont la taille varie selon l’espèce, et qui permettrait l’adhésion à un substrat, le déplacement de particules voire la capture de proies. Haptophytes : Groupe d'algues unicellulaires caractérisées par la présence d'un appendice particulier différent des flagelles, l'haptonème. Hétérogénératée : Etat d’un végétal présentant des générations morphologiquement différentes Hétéromorphe : De morphologie différente; terme utilisé, entre autres, pour caractériser l’alternance morphologique de générations d’un cycle de vie. Hétérothallisme/homothallisme/pseudo-homothallisme: Ces termes décrivent les modalités de reproduction chez certains organismes, en particulier les champignons (au sens large). - Un organisme homothallique peut engager la reproduction sexuée en absence de partenaire (autofertilité), alors qu'un organisme hétérothalliquenécessite la présence d'un partenaire de type sexuel génétiquement compatible (autostérilité).
- Le type sexuel (mating type en anglais) est dit bipolaire ou monofactoriel s'il en existe deux formes : exemple mata et matA chez de nombreux ascomycètes. Il est dit tétrapolaire ou bifactoriel si deux gènes interviennent pour définir le type sexuel, les combinaisons compatibles peuvent alors être complexes, c'est le cas chez de nombreux basidiomycètes.
- Un organisme est pseudo-homothallique si au cours de la reproduction sexuée 2 cellules de types sexuels différents sont nécessaires et si celles-ci sont portées par le même thalle issu de la reproduction sexuée (le thalle est alors une mosaïque de cellules des deux types sexuels et est donc autofertile !). On rencontre par exemple cette situation chez quelques ascomycètes comme Podospora anserina.
- un organisme est asexué si la reproduction sexuée n'est pas présente au cours de son cycle (ex, certains champignons ou certains rotifères). Attention, un organisme sexué est un organisme qui non seulement pratique la reproduction sexuée mais pour lequel la production des gamètes mâles et femelles se fait sur des individus différents. Hétérotrophe : Se dit d'un organisme qui dépend des substances organiques pour son alimentation. Holocarpie : Type de reproduction où tout le contenu du thalle se transforme en éléments fertiles; le thalle meurt ensuite (par exemple chez Caulerpa). Hydrophyte : Végétal vivant sur un substrat constamment imprégné d’eau. Intercalaire: Terme descriptif de croissance, quand celle-ci est localisée entre deux cellules ou deux régions du thalle. Intertidal : Se dit de la zone recouverte d'eau à marée haute et exposée à l'air libre à marée basse. Se rapporter à marée haute et à marée basse. Intraplastidial: Localisé dans le stroma du plaste. Ioduque: Cellule
sécrétrice (contenant de l’iode ou d’autres halogènes) présente chez certaines
Rhodophytes. Isomorphe : De même morphologie; terme utilisé, entre autres, pour caractériser l’alternance morphologique de générations d’un cycle de vie. Laminarane: Polysaccharide de réserve (essentiellement à base de glucose) chez certaines Chromophytes. Ligne des basses eaux : Niveau minimal atteint par un cours d’eau en période sèche ou
selon les fluctuations naturelles. Mésoplastidié: Type de structure plastidiale caractérisant les algues ayant un réseau d’éléments plastidiaux réunis entre eux par des parties beaucoup plus fines. Mésotrophe : État transitoire, stade intermédiaire d’un lac entre le stade
oligotrophe et le stade eutrophe. Les lacs mésotrophes sont caractérisés par un
enrichissement en matières organiques, une quantité de végétaux moyenne et un
certain déficit en oxygène. Mitose: La mitose permet aux cellules de se reproduire identiques à elles mêmes. Le matériel génétique de départ de mitose est divisé par deux à l'arrivée.Pendant le cycle cellulaire, la chromatine (matériel génétique) subit différents états : elle est compactée en chromosomes au début de la mitose, décondensée en fin de mitose. Monoïque: Espèce où il n’existe qu’un type d’individu fertile, engendrant à la fois des gamètes mâles et femelles. Morphologie : Description des formes extérieures des êtres vivants. Multiaxial: Type de structure où le thalle est engendré conjointement par plusieurs axes (comparer avec uniaxial). Mycélium : Appareil végétatif caractéristique des Champignons. Thalle formé de filaments, le plus souvent souterrains, donc inaperçus, et provenant de la germination des spores. Myciculture ou fungiculture: La myciculture ou fungiculture est la culture des champignons comestibles. Elle se fait généralement dans des champignonnières. Mycologue: Personne spécialiste dans l'étude des champignons ou plus scientifiquement, des mycéliums. Mycologie: Science botanique qui étudie les champignons ou plus précisément des mycéliums. Néoplastidié: Type de structure plastidiale caractérisant les algues qui possèdent plusieurs plastes par cellule. Niche :
Description des rôles et associations d'une espèce donnée dans la communauté à
laquelle elle appartient. Oogone: Cellule représentant un gamétocyste femelle, contenant une ou plusieurs oosphéres (ces dernières sont des gamètes non flagellés). Oosphère : Gamète
femelle immobile. Paramylon: Polysaccharide (à
base de glucose) chez les Euglénophytes. Parasite : Organisme se nourrissant aux dépens d’un autre être vivant. Pariétal: Lié à la paroi; par exemple, un plaste pariétal est un plaste localisé près de la paroi de la cellule. Parthénogénétique: Développement d’un gamète femelle, sans fécondation, en un
nouvel individu. Photophile: (Terme
d’écologie) qui aime la lumière; se dit des végétaux adaptés à de fortes
énergies lumineuses. PhycocoIloïde : Terme général désignant les colloïdes extraits des algues (par exemple I’agar et les alginates). Phycocyanine : Pigment bleu-vert des Cyanophytes et Rhodophytes. Phycoérythrine : Pigment rouge des Rhodophytes et Cyanophytes. Physodes : Inclusions réfringentes dans les cellules de certaines algues (abondantes chez les Chromophytes/Phéophycées) riches en composés phénoliques; se colorent en rouge avec la vaniline-chlorhydrique et en bleu avec le bleu de CrésyIe. Phytoplancton : Ensemble d’algues microscopiques, comme les diatomées et les
dinoflagellés, qui font partie du plancton et qui vivent en suspension dans
l'eau. Planogamie : Union de deux gamètes mobiles. Plaste: Organite cellulaire (limité par une double membrane au niveau ultrastructural) contenant les pigments et/ou l’amidon (chloroplaste, phéoplaste, rhodoplaste, amyloplaste). On distingue les individus homoplastidiés (tous les plastes sont semblables) de ceux hétéroplastidiés (spécialisation d’amyloplates pour le stockage de l’amidon et de chloroplastes pour la photosynthèse). Pluriloculaire: Cyste qui, chez certaines Chromophytes, est formé de nombreuses logettes (chaque logette libère un seul zoïde). Plurisérié: Formé d’une seule file de cellules quand celles ci sont recloisonnées longitudinalement (comparer avec unisérié); se dit aussi quand le thalle est formé de plusieurs files cellulaires. Polystique: Type de structure caractérise par des cellules recloisonnées suivant des plans longitudinaux (comme chez Halopteris par exemple). Pollution : Situation causée par la présence d'une substance, d'un organisme ou d'énergie en quantités telles que la qualité de l'environnement en est altérée. Pore: Orifice de crypte pilifère, de conceptacle, ou de cystocarpe; on dit aussi ostiole; pour le pore d’un cystocarpe on dit aussi carpostome. Procaryote (ou protocaryote): Cellule ne possédant pas de “vrai” noyau ni certains autres organites cellulaires comme les plastes; par extension, groupe d’organismes possédant ces caractéristiques. Producteurs primaires : Végétaux qui fabriquent de la nourriture au moyen de la lumière solaire pour d'autres organismes. Pyrénoïde: C’est une structure cellulaire interne aux chloroplastes des algues il concentre les enzymes responsables de la photosynthèse. Chez les algues vertes, le pyrénoïde est entouré de grains d’amidon. Réceptacle: Partie différenciée et localisée des thalles, souvent renflée, qui porte les conceptacles fertiles chez certaines Chromophytes. Renaturalisation : Technique d’implantation de plantes herbacées et arbustives sur les rives qui est utilisée pour corriger des problèmes d’érosion ou pour redonner un cachet naturel. Rhizoïde: Excroissances cellulaires ou files de cellules généralement situées à la base d’un thalle et participant à la fixation. Rhizomes: Tiges “vraies” des Phanérogames (et donc jamais présentes chez les thallophytes) généralement rampantes et enfoncées dans les sédiments; à ne pas confondre avec racines (dont la structure anatomique est différente). Rive : Partie du
milieu terrestre attenant à un lac ou à un cours d’eau. La rive assure la
transition entre le milieu aquatique et le milieu strictement terrestre. Elle
permet le maintien d’une bande de protection de 10 ou 15 mètres de largeur sur
le périmètre des lacs et cours d’eau. Schizogonie : processus cellulaire au cours duquel un plasmode plurinucléé se transforme en cellules uninucléées. Sciaphile: (Terme
d’écologie) qui aime l’ombre; se dit des végétaux adaptés à de faibles énergies
lumineuses. Spermatocyste : Gamétocyste contenant les gamètes mâles (ces derniers sont en
général nombreux). Sporocyste : Organe caractéristique des Thallophytes produisant des spores.
Il provient d’une cellule mère dont tout le contenu se transforme en spores. Stipe: Partie d’un thalle, souvent cylindrique et ayant l’apparence d’une tige, comprise entre la base de fixation et le reste du thalle (chez Laminaria par exemple). Stolon : Filament
grêle s’étalant dans le milieu et assurant la propagation végétative de
l’espèce. Taxon: Une unité
taxinomique d’un niveau quelconque (espèce, genre, famille, etc.). Tétrasporocyste: Chez les Rhodophytes, sporocyste produisant quatre tétraspores, généralement avec méiose. Thallophyte : Végétal constitué par un thalle (sans feuilles, tiges, racines); Tophules : Chez Cystoseira, renflements du thalle avec accumulation de réserves, généralement situés à la base de rameaux caducs; ils sont à l’origine de la repousse ultérieure des nouveaux rameaux. Tourbières : Milieux recouverts ou constitués de tourbe et dont la nappe
phréatique est généralement élevée. Ils correspondent souvent à d’anciens lacs
envahis par la végétation. La tourbière est un milieu où les plantes sont
souvent à leur limite de tolérance. Une légère variation dans les caractéristiques
(ex. : pH) peut entraîner l’élimination des espèces présentes. Il existe deux
grandes catégories de tourbières : Bog (tourbière ombrotrophe) : milieu acide
alimenté par l’eau de pluie et caractérisé par une dominance de sphaignes et
éricacées. Fen (tourbière minérotrophe) : milieu moins acide que la bog et
dominé par des herbacées et d’autres mousses que les sphaignes. Trichoblastes : Filaments unisériés, ramifiés, incolores et caducs, présents dans les parties jeunes de certaines Rhodophytes (par exemple Laurencia). Trichogyne : Filament terminal du carpogone ou de l’ascogone. Trichothallique : Se dit d’une croissance assurée par un méristème intercalaire qui engendre d’un côté une ou plusieurs files de cellules (caduques) et de l’autre côté les tissus (persistants) du thalle. Turbidité : Condition plus ou moins trouble d'un liquide causée par la présence de matières en suspension. Uniaxial: Type de structure où le thalle est engendré par un seul axe; la structure peut cependant être haplostique ou polystique. Uniloculairee : Cyste qui, chez les Chromophytes, est formé par une seule loge contenant de nombreux zoïdes. Unisérié : Forme d’une seule file de cellules. Valve : Partie du frustule des diatomées. Vasculaire : Relatif aux vaisseaux d'une plante, qui servent au transport des
liquides. Xanthophylle : Pigment photosynthétique surnuméraire (caroténoïde oxydé), jaune orange, particulièrement abondant chez certaines Chromophytes. Xylane : Terme général désignant des polysaccharides dont la molécule de base est le xylose. Zoïde : Cellule reproductrice flagellée; terme utilisé quand la nature exacte (gamète ou spore) de cette cellule est inconnue. Zoospore : Spore flagellée (donc mobile). Zygospore : Zygote enkysté des Zygomycètes. |
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